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酷杰、安娜、糊涂蔡在小机器人的帮助下一起复原植物残本，并整理出一套全新的电子版的《植物图文大全》他们在地球各地寻找各种不同稀有植物、名贵植物、濒危植物等等。

本片讲述了未来世界，星际联盟的科学家诸葛博士利用基因技术复活史前动物，在地球上建立史前动物馆但此馆各种功能尚未完善，史前动物一时也无法完全适应，出现各种麻烦，酷杰、糊涂蔡、安娜负责解决这些麻烦。

莉莎博士科研团队研制出一种新型时光穿梭机，她给酷杰三人一个崭新的任务，那就是穿梭时空去古生物时代实地考察恐龙，并采集几十种恐龙的基因回来，这对研究生物的演化以及对现代动物的物种保护都有非常重要的意义